Бадахша́н (перс. بدخشان / тадж. Бадахшон, кит. 巴達克山 — «Горы Бадах») — историческая область Памира, расположенная на территории юго-восточного Таджикистана — Горно-Бадахшанская автономная область, и северо-восточного Афганистана — провинция Бадахшан.
В 1895 году по соглашению между Российской и Британской империями Бадахшан был разделён на две части: северная часть отошла Российской империи, а южная — Британской империи.
По мнению узбекского историка Шамсуддина Камалиддинова, Бадахшаном в Средние века называлась лишь Южный Бадахшан — область к юго-западу от Вахана, занимающую долину реки Кокча и территорию к северу и к югу от неё и в настоящее время входящую в состав Афганистана. А на теперешнюю Горно-Бадахшанскую автономную область Таджикистана то название «Бадахшан» стало распространяться в эпоху позднего Средневековья, когда эта территория входила в состав Бадахшанского бекства. В Средние века на её территории были расположены три отдельные области: Дарваз, Шугнан и Вахан.